با تسلط یافتن وهابیون بر مدینه، قبور ائمه شیعه و بسیاری از بزرگان اسلام توسط این فرقه منحرف ویران گردید.
تا آن زمان، بر روی قبور ائمه شیعه و سایر بزرگان اسلام که در مدینه مدفون بودند، گنبد قرارداشت.
اما از این زمان به بعد وهابیون باتخریب قبور و از بین بردن ضریح و گنبدی که بر روی تربت ائمه و بزرگان اسلام قرار داشت، مسلمانان را از فیض زیارت بارگاه آن بزرگواران محروم ساختند.
(تصویر؛ بارگاه ائمه‌هدی(ع)دربقیع)
از جمله قبوری که در جریان این واقعه ویران گردید، بارگاه و مقبره‌ی امام حسن مجتبی(ع)، امام سجاد(ع)، امام محمد باقر(ع) و امام جعفر صادق(ع) بود.
همچنین قبر حضرت عبدالله و حضرت آمنه پدر و مادر حضرت رسول(ص)، مالک پیشوای مالکی، عباس عموی پیامبر، اسماعیل از فرزندان امام صادق(ع) و.
.
.
نیز ویران گردید.
این حرکت وحشیانه وهابیون، جهان اسلام، به ویژه ایرانیان را شدیداً متأثر نمود.
با فشار علمای ایران، دولت وقت فردی را مامور بررسی ابعاد واقعه کرد.
این فرد میرزا حبیب‌الله هویدا، پدر امیرعباس هویدا، از بزرگان بهائیت بود! که در آن زمان در وزارت امور خارجه فعالیت می‌کرد.
وی پس از بازدید از بقیع، گزارشی به نفع سعودی‌ها تنظیم کرد و به دربار ایران این‌گونه نوشت؛ «جز چند گلوله که در اثر جنگ قوای شریف حجاز و آل سعود به گنبد ها خورده و مشخص نیست از جانب کدام گروه شلیک شده در بقیع اتفاق خاصی نیفتاده است!»
در واقع این عنصر فرقه بهائی، به یاری وهابیت که فرقه همزاد استعماری بهائیت در عربستان بود، کوشید با گزارش‌های ناقص خود از حساسیت ایران نسبت به ابعاد فاجعه بکاهد و موجبات تحکیم دولت وهابی آل سعود را در حجاز فراهم کند.