2- تشکیل مجمع تشخیص مصلحت نظام (1366 ش)
پس از تشکیل مجلس شورای اسلامی و شورای نگهبان، مواردی به وجود آمد که این دو نهاد با هم اختلاف نظر پیدا می‌کردند و در هر مورد نظر حضرت امام(ره) را اعمال می‌نمودند.
سرانجام در اواسط بهمن 1366 از سوی رییس مجلس، رییس دیوان عالی کشور و حاج احمد خمینی نامه‌ای خطاب به امام نگاشته و از ایشان درخواست شد که برای حل عملی مسائل، مرجعی را تعیین کنند تا باعث حل اختلاف بین مجلس و شورای نگهبان گردد.
حضرت امام نیز در 17 بهمن آن سال، فرمان تشکیل مجمع تشخیص مصلحت نظام مرکب از اعضای شورای نگهبان، رؤسای سه قوه و… را صادر کردند.
این مجمع، مشروعیت و قانونی بودن تصمیمات خود را تا قبل از بازنگری قانون اساسی در سال 1368، از اختیارات ولایت مطلقه فقیه که قانون اساسی آن را به رسمیت می‌شناخت، اتخاذ می نمود ولی پس از بازنگری قانون اساسی، جایگاه این مجمع در قانون اساسی تعیین شد.
اعضای ثابت و متغیر این مجمع را مقام معظم رهبری منصوب می‌نمایند.